ปัจจุบันก็ยังไม่มีใครทราบสาเหตุที่แน่ชัดว่าเนื้องอกมดลูกเกิดขึ้นจากอะไร แต่สันนิษฐานว่าอาจเกิดจากพันธุกรรม เนื่องจากพบในครอบครัวสืบทอดกันมาค่อนข้างบ่อย นอกจากนั้นปัจจัยเรื่องของฮอร์โมนเพศหญิงก็มีส่วนทำให้เกิดเนื้องอกมดลูกด้วย ซึ่งทางการแพทย์เชื่อว่าเนื้องอกมดลูกที่เกิดขึ้นนี้จะถูกเลี้ยงด้วยฮอร์โมนเพศหญิง จึงเป็นสาเหตุที่ทำให้เนื้องอกมดลูกโตขึ้น
ตรงนี้นี่เองที่บอกได้ว่าทำไมคนในวัย 50 ปีขึ้นไปถ้ามีเนื้องอกในกล้ามเนื้อมดลูก แล้วอยู่ๆ เนื้องอกฝ่อไปได้เองเอง เพราะคนในวัยนี้ฮอร์โมนจะหมดแล้ว เนื้องอกจึงไม่มีอะไรเลี้ยงในที่สุดจึงฝ่อไป อีกประการที่สำคัญก็คือปัจจัยจากสภาวะแวดล้อมและไลฟ์สไตล์การใช้ชีวิตการกินอยู่ของคนในยุคปัจจุบัน การรับประทานเนื้อสัตว์มากๆ เนื้อแดงมากๆ การดื่มแอลกอฮอล์ พฤติกรรมเหล่านี้ก็เป็นการเพิ่มความเสี่ยงให้เกิดเนื้องอกได้มากทีเดียว